1、組織機(jī)構(gòu)問(wèn)題
公司的組織機(jī)構(gòu)為股東會(huì)、董事會(huì)（執(zhí)行董事）、監(jiān)事會(huì)（監(jiān)事）、經(jīng)理。很多投資者特別是剛剛開始下海創(chuàng)業(yè)的專業(yè)技術(shù)人員對(duì)股東會(huì)、董事會(huì)、監(jiān)事會(huì)、經(jīng)理這些組織機(jī)構(gòu)的定位和功能認(rèn)識(shí)比較模糊，由此也造成股權(quán)糾紛、公司治理糾紛的多發(fā)。
必須明確，股東會(huì)、董事會(huì)、經(jīng)理這是三個(gè)獨(dú)立的管理機(jī)構(gòu)（監(jiān)事會(huì)屬于監(jiān)督機(jī)構(gòu)）。股東無(wú)論大小首先是股東會(huì)的成員，這是毫無(wú)疑義的。股東會(huì)選舉董事形成董事會(huì)對(duì)公司進(jìn)行經(jīng)營(yíng)管理，董事不一定是股東，這時(shí)股東會(huì)與董事會(huì)就分離開了，各司其職，不能代替。董事會(huì)又聘了總經(jīng)理來(lái)管理公司的日常工作，總經(jīng)理對(duì)董事會(huì)負(fù)責(zé)，而不是對(duì)股東負(fù)責(zé)。由此可見(jiàn)，股東投資以后，有可能根本不是董事，更不是總經(jīng)理，股東與公司之間的關(guān)系僅僅是股權(quán)關(guān)系，與公司聯(lián)系的途徑僅僅是股東會(huì)。還有一種可能是，股東投資公司以后，即是公司的董事甚至董事長(zhǎng)，又是公司的總經(jīng)理，公司的大小事務(wù)都在其一人完全的控制之下。很多小公司都屬于這種情況。此時(shí)如果公司是一人公司，或者是實(shí)質(zhì)上的一人公司，可能出現(xiàn)的糾紛還少些，如果股東并非一人，還有其他小股東，股東之間以及股東與公司之間可能就會(huì)產(chǎn)生各種各樣的問(wèn)題，這就是所謂的“公司訴訟”糾紛。要解決這些問(wèn)題，一方面要依法辦事，公司的經(jīng)營(yíng)管理應(yīng)該符合公司法、工商管理法規(guī)、稅法等要求，另一方面，需要投資人也要對(duì)公司法及公司運(yùn)作有個(gè)清楚、合理的認(rèn)識(shí)。股東會(huì)作為有限責(zé)任公司的權(quán)力機(jī)關(guān)，行使下列職權(quán)：(1)決定公司的經(jīng)營(yíng)方針和投資計(jì)劃；(2)選舉和更換非由職工代表?yè)?dān)任的董事、監(jiān)事，決定有關(guān)董事的報(bào)酬事項(xiàng)；(3)審議批準(zhǔn)董事會(huì)的報(bào)告；(4)審議批準(zhǔn)監(jiān)事會(huì)或者監(jiān)事的報(bào)告；(5)審議批準(zhǔn)公司的年度財(cái)務(wù)預(yù)算方案、決算方案；(6)審議批準(zhǔn)公司的利潤(rùn)分配方案和彌補(bǔ)虧損方案；(7)對(duì)公司增加或者減少注冊(cè)資本作出決議；(8)對(duì)發(fā)行公司債券作出決議；(9)對(duì)公司合并、分立、解散、清算或變更公司形式作出決議；(10)修改公司章程；(11)公司章程規(guī)定的其他職權(quán)。

有限責(zé)任公司股東會(huì)可依職權(quán)對(duì)所議事項(xiàng)作出決議。一般情況下，股東會(huì)會(huì)議作出決議時(shí)，采取“資本多數(shù)決”原則，即由股東按照出資比例行使表決權(quán)。但公司章程可以對(duì)股東會(huì)決議的作出方式另行予以規(guī)定，而不按出資比例行使表決權(quán)。

2、經(jīng)營(yíng)場(chǎng)所問(wèn)題
公司必須有個(gè)注冊(cè)和經(jīng)營(yíng)的場(chǎng)所。有些投資者隨便找個(gè)能注冊(cè)的地址作為公司登記的地址，實(shí)際上在另一個(gè)地址經(jīng)營(yíng)，在工商管理上稱作“異地經(jīng)營(yíng)”，會(huì)受到工商管理機(jī)關(guān)的處罰。有的公司實(shí)際并沒(méi)有具體的經(jīng)營(yíng)場(chǎng)所，這種投資人實(shí)際上也不是真正地把公司作為事業(yè)來(lái)做，自然另當(dāng)別論了。