商業(yè)秘密侵權(quán)糾紛案件的舉證責任實行“誰主張、誰舉證”和一定范圍內(nèi)“舉證責任倒置”的原則。在商業(yè)秘密侵權(quán)糾紛案件中，權(quán)利人主張其商業(yè)秘密被侵犯，需對該主張?zhí)岢鲎C據(jù)證明，即“誰主張、誰舉證”；但在證據(jù)被對方掌握而無法以合法手段收集時，法院會要求被控侵權(quán)人提出其獲得信息來源合法的證據(jù)，否則會作出對其不利的判決，即“舉證責任倒置”。

我國民事訴訟法確立的舉證責任原則為“誰主張、誰舉證”。根據(jù)《最高人民法院關(guān)于民事訴訟證據(jù)的若干規(guī)定》第二條的規(guī)定：“當事人對自己提出的訴訟請求所依據(jù)的事實或者反駁對方訴訟請求所依據(jù)的事實有責任提供證據(jù)加以證明。沒有證據(jù)或者證據(jù)不足以證明當事人的事實主張的，由負有舉證責任的當事人承擔不利后果?！痹谏虡I(yè)秘密侵權(quán)糾紛案件中，權(quán)利人（原告）要證明商業(yè)秘密被侵犯，一般需向法院提供以下幾項證據(jù)：商業(yè)秘密存在的相關(guān)證據(jù)（包括：相關(guān)技術(shù)、經(jīng)營信息客觀存在；具有合法權(quán)屬；具有經(jīng)濟價值；并經(jīng)采取了相應(yīng)的保密措施）；被控侵權(quán)人（被告）實施侵權(quán)行為的證據(jù)（有機會接觸到相關(guān)商業(yè)秘密信息并采取了某些行為）；被告具有故意或過失的證據(jù)；原告因被告的侵權(quán)行為所造成的損害后果的證據(jù)（包括侵權(quán)范圍、經(jīng)濟賠償以及為調(diào)查被告侵害其商業(yè)秘密所支付的合理費用）。

另外，應(yīng)值得注意的是，在涉及到與權(quán)利人商業(yè)秘密存在的相關(guān)證據(jù)的舉證時，司法實踐中在一定范圍內(nèi)實行舉證責任倒置原則。早在1998年，最高法院就在《關(guān)于全國部分法院知識產(chǎn)權(quán)審判工作座談會紀要》中指出：“人民法院對于當事人的某些主張，應(yīng)當根據(jù)法律并從實際情況出發(fā)，實行‘舉證責任倒置’的原則，即一方對于自己的主張，由于證據(jù)被對方掌握而無法以合法手段收集證據(jù)時，人民法院應(yīng)當要求對方當事人舉證。”也就是說，在商業(yè)秘密侵權(quán)糾紛案中，被告應(yīng)當提供其獲得信息來源合法的證據(jù)，若其不提供，則法院可根據(jù)查明的事實，認定被告侵權(quán)。