一、非法搜查罪的認定
1、本罪與搜查工作中的錯誤行為的界限
例如，偵查人員依法搜查時沒有請見證人到場，或者沒有向被搜查人出示搜查證，搜查婦女身體時不是由女工作人員進行等，屬于合法搜查中的錯誤行為。
2、本罪與非法搜查為手段的其他犯罪的界限
非法搜查罪一般是以目的行為不構成犯罪（如為了查找欠物）為前提的，如果行為人出于其他犯罪目的（如為了搶劫）而對他人人身或住宅進行搜查的，應以目的行為吸收非法搜查行為，按目的行為定罪，如定搶劫罪。
3、本罪與非法侵入住宅罪的界限
兩者常常具有一定的牽連關系。當行為人非法侵入他人住宅的目的是為了進行非法搜查時，一般以后一行為吸收前一行為，定非法搜查罪。但是，如果前一行為情節(jié)惡劣而后一行為情節(jié)一般，則以前一行為吸收后一行為，定非法侵入住宅罪。
4、本罪與搶劫罪、盜竊罪、侮辱婦女罪界限
后面這些犯罪在客觀方面亦可能采取非法搜查的行為，此時非法搜查僅是實施其犯罪的手段行為，如盜竊犯罪分子在侵入他人住宅后非法翻箱倒柜、盜走他人珍貴物品的，就包括了非法搜查的牽連行為，此時，如果構成他罪的，應擇一重罪即后者定罪科刑。倘若不構成他罪，如非法搜查后僅是盜取少量財物，但情節(jié)惡劣構成犯罪的，則可以以本罪論處，而把其他行為作為本罪的一個量刑情節(jié)予以考慮。5、與偽造、變造、買賣國家機關證件罪界限，盜竊、搶奪國家機關證件罪的界限一般情況下，本罪與后者不會發(fā)生混淆。但在偽造、變造或者買賣司法機關的搜查證后又進行非法搜查的，其既觸犯本罪與后罪，對之，可以牽連犯擇一重罪處罰的原則進行處理。如果行為人出于非法占有的目的，在偽造司法機關的搜查證后又冒充司法人員進行搜查，且劫取他人財物的，則應以搶劫罪定罪科刑，而不是構成本罪，亦不是構成偽造國家機關證件罪等。
二、非法搜查罪的量刑
刑法第二百四十五條規(guī)定，非法搜查他人身體、住宅，或者非法侵入他人住宅的，處三年以下有期徒刑或者拘役。
司法工作人員濫用職權，犯前款罪的，從重處罰。
